临床主要用于治疗肛周脓肿术后、化脓性扁桃体炎、乳腺炎、产后乳汁不行、糖尿病周围神经病变等病症。

1.肛周脓肿术后：以透脓散治疗20例，与黄连解毒汤治疗20例对照。21日后评价疗效，以创面愈合时间、愈合率及肉芽生长情况为疗效评价标准。结果：治疗组治愈率75%，对照组治愈率60%。(《河南中医》2014年第4期)

2.化脓性扁桃体炎：以本方加味治疗20例，疗程为7日，以扁桃体的改善程度为评价指标。结果：治愈10例，好转7例，无效3例。(《云南中医中药杂志》2002年第2期)

3.乳腺炎：以透脓散加味治疗郁滞性乳腺炎56例，疗程2～14日，以临床症状的改善和局部肿块的消失为临床评价指标.结果：治愈51例，好转5例，治愈率91.07%。(《中国民间疗法》2006年第10期)

4.产后乳汁不行：以本方加味治疗66例，疗程为5日，以乳汁分泌量判断疗效。结果：治愈59例，显效6例，无效1例，治愈率为89.39%。(《吉林中医药》2005年第1期)

5.糖尿病周围神经病变：以本方加味治疗88例，与甲钴胺治疗47例对照。疗程为30日，以临床症状及血糖的改善为评价指标。结果：治疗组显效60例(68.18%)，有效26例(29.55%)，无效2例(2.27%)，总有效率97.73%；对照组4显效10例(21.28%)，有效26例(55.32%)，无效11例(23.40%)，总有效率76.60%。两组比较差异有统计学意义。(《北京中医药大学学报》2000年增刊)。