临床主要用于治疗小儿支原体肺炎、慢性支气管炎急性期、单纯乳腺增生等病症。

1.小儿支原体肺炎：以贝母瓜蒌散加味治疗小儿支原体肺炎30例，与阿奇霉素治疗30例作对照，2周为1个疗程。以咳嗽、咳痰、肺部体征消失，体温及异常理化指标恢复正常，评分比值<0.2(治疗后值/治疗前值)为治愈标准。结果：治疗组总有效率96. 67%，对照组86. 67%，两组疗效相当。(《山东中医杂志》2010年第11期)

2.慢性支气管炎：急性期采用贝母瓜蒌散治疗慢性支气管炎急性期35例，与中成药祛痰灵治疗35例作对照，疗程10日。以5日内症状减轻、体征大部分消失为显效标准。结果：治疗组总有效率91.4%，对照组77. 1%，两组比较有显著性差异。(《现代中医药》2003年第6期)

3.单纯乳腺增生：应用逍遥散合贝母瓜蒌散加减治疗单纯乳腺增生100例，与乳癖消中成药治疗50例作对照，疗程20日。结果：治疗组总有效率97%，对照组56%,两组比较有统计学意义。(《山西中医学院学报》2009年第5期)