临床主要用于治疗冠心病、类风湿关节炎、肝纤维化、病毒性心肌炎、过敏性紫癜性肾炎等病症。

1.冠心病：用复方丹参注射液穴位注射治疗冠心病心绞痛患者126例，与二硝酸异山梨酯治疗126例随机对照，疗程14日。以临床表现和心电图作为疗效评价指标。结果：治疗组有效率分别为88.9%和81.7%，两组差异有统计学意义。(《时珍国医国药》2006年第1期)

2.类风湿关节炎：复方丹参注射液静滴配合常规药物治疗活动期类风湿关节炎患者212例，与仅用常规药物治疗106例随机对照，疗程20日。以触痛关节数、肿胀关节数、晨僵时间、双手握力，患者疼痛程度评估、患者对疾病的总体评估、医生对疾病的总体评估、HAQ、DAS28、ESR、CRP和RF共11项指标评定疗效。结果：两组患者治疗后与同组治疗前比较，各项指标均有明显改善(P<0.05)。两组患者的不良反应及安全性指标无显著性差异(P>0.05)。(《辽宁中医杂志》2010年第10期)

3.肝纤维化：本方静滴治疗肝纤维化患者216例，与西药(能量合剂、支链氨基酸静滴)治疗198例随机对照，疗程1～2个月。以临床表现及肝功能、肝纤维化指标为疗效评价指标。结果：临床表现、ALT、AST及肝纤维化指标治疗组疗效明显于对照组(P0.05)。(《中华中医药学刊> 2011年第6期)

4.病毒性心肌炎：本方静滴配常规综合措施治疗新生儿病毒性心肌炎患者30例，与仅用常规综合措施治疗30例随机对照，以临床症状、X线、心电图及心肌酶等为疗效评价指标。结果：观察组治愈率、总有效率高于对照组，两组比较有差异有统计学意义(P<0.01)；治疗时间上，治疗组明显小于对照组，两组比较有差异有统计学意义。(《中国妇幼保健》2009年第7期)

5.过敏性紫癜性肾炎：复方丹参注射液静滴配合泼尼松口服治疗治疗过敏性紫癜性肾炎患者20例，与仅用醋酸泼尼松口服治疗30例随机对照，2周为1个疗程，观察2个疗程。以血浆蛋白、尿蛋白、尿红细胞差异为疗效评价指标。结果：治疗后两组比较，血浆蛋白、尿蛋白、尿红细胞差异均有统计学意义(P<0.05)。(《山东医药》2007年第31期)