临床主要用于治疗胃炎、胃溃疡、腹泻等病症。

1.胃炎：香砂六君子汤加减治疗慢性萎缩性胃炎患者31例，与摩罗丹治疗组31例患者对照，疗程为3个月。临床疗效评价以症状体征消失、食欲正常、胃镜示胃黏膜慢性炎症好转为痊愈标准。结果：总有效率治疗组为93.54%，对照组为61.29%;胃镜示观察组19例患者胃黏膜恢复正常或有所恢复，对照组19例患者胃黏膜恢复正常或有所恢复;幽门螺旋杆菌检查治疗组15例转阴，对照组7例转阴。(《中药药理与临床》2014年第6期)

2.胃溃疡：香砂六君子汤加味治疗胃溃疡患者60例，与西药(硫糖铝、盐酸雷尼替丁、阿莫西林、甲硝唑)治疗组60例患者对照，疗程为4周。临床疗效评价以胃镜检查溃疡面愈合，局部没有明显红肿，症状基本消失为治愈标准。结果：总有效率治疗组为85%，对照组为63.33%。对两组患者进行为期半年的随访，治疗组复发4例，由于对照组复发15例。(《中国中医急症》2014年第4期)

3.胃下垂：香砂六君子汤加减治疗胃下垂患者74例，疗程为2个月。临床疗效评价以患者自觉症状缓解，X线钡餐透视检查显示胃小弯切迹位于髂嵴连线以上为治愈。结果：74例患者中治愈30例，好转35例，无效9例，总有效率为87.8%。治愈的30例患者其病程均为2年以内;治疗无效的9例患者，其中8例病程在5年以上，1例为病程2年，但胃下垂症状严重。(《新疆中医药》2014年第6期)

4.腹泻：香砂六君子汤加减联合补液、对症支持疗法治疗小儿腹泻患者20例，与单纯补液、对症支持治疗患者20例对照，疗程为1周。临床疗效评价以大便成形，每日1~2次，全身症状消失、进食正常为治愈标准。结果：总有效率治疗组为90%，对照组为75%。(《湖南中医杂志》2014年第8期)

5.肠易激综合征：本方治疗肠易激综合征患者36例，与西药[地西泮(安定)、普鲁苯辛、多潘立酮(吗丁啉)]治疗组21例患者对照，疗程为2周。临床疗效评价以主要症状和体征基本消失为显效。结果：总有效率治疗组为97.2%，对照组为76.2%。(《湖北中医杂志》2002年第8期)