北京协和医院呼吸内科是由我国已故著名呼吸病学专家——朱贵卿教授创建的、具有悠久历史的学科专业。作为我国最早成立的呼吸科专业科室之一，北京协和医院呼吸内科是我国一流的呼吸科学临床和研究中心及呼吸疑难病诊治中心，拥有众多的我国呼吸专业的老前辈或知名教授。曾在或正在这里执教和工作的既有荣获“中国呼吸医师终身成就奖” 的罗慰慈教授和朱元珏教授，亦有荣获“中国呼吸医师奖” 的黄席珍教授、李龙芸教授、蔡柏薔和陆慰萱教授，还有荣获“中华医学会呼吸分会杰出贡献奖”的林耀广教授等人。
协和呼吸科目前包括11个分组，分别为慢性阻塞性肺疾病组、睡眠呼吸障碍组、间质性肺病组、肺癌中心、肺栓塞与肺血管疾病组、哮喘组、危重症医学组、感染组、介入组、呼吸治疗组和控烟组。呼吸科目前在职医生共有33人，包括主任医师10人，副主任医师10人和主治医师13人。徐作军教授领导的多科协助诊治的间质性肺病组，王孟昭和张力教授领导的多科协助的肺癌诊治中心、肖毅教授领导的呼吸睡眠中心，以及施举红和徐凯峰教授领导的肺血管疾病组具有完整的团队构成，也是科室目前的特色。
每年一度的“北京协和呼吸病学峰会”至今已举办12届，深受全国呼吸同道的喜欢。呼吸科还每年举办《北京协和医院呼吸病学峰会学习班》、《呼吸系统疑难病暨弥漫性间质性肺病研讨会》、《帅府园论坛呼吸疾病进展与规范化治疗精品学习班》和《胸部恶性肿瘤诊治新思考学习班》等多种学习班，以促进呼吸学科的推广和发展。
